Родился 28 августа 1903 г. в местечке Зехсиш-Реген в Семиградье (б. Австро-Венгрия) в купеческой семье. Учился в Берлине и уже в 20-е гг. был известен как автор нескольких одноактных опер («Голый король» по Андерсену, 1928; «Сганарель» по Мольеру, 1923, 2-я ред. 1929). Первая его большая опера «Фаворит» (1935) пользуется и сегодня значительным успехом. За ней последовали «Граждане Кале» (1939), «Иоганна Балк» (1941) — все три оперы на либретто Каспара Неера, потом «Прометей» по трагедии Эсхила на собственный текст (1939) и «Флунский рудник» на либретто Гуго фон Гофмансталя (1931). Рудольф Вагнер-Регени был членом Баварской академии искусств. Он умер 18 сентября 1969 г.
Вагнер-Регени — автор нескольких балетов; он сочинял в 20-е гг. музыку для балетной труппы Рудольфа фон Лабана, реформатора и теоретика современного балета. В своих театральных произведениях Вагнер-Регени стремился к лаконичным формам, ясности и плакатной резкости образов. В Германии этого композитора ценят также и за его инструментальную музыку, за мастерское владение сложной современной техникой музыкального письма.